La cupola, costruita nal 1591 per volere del canonico della cattedrale di Firenze, Giovan Battista Capponi, è in scala perfetta con quella del Brunelleschi del duomo cittadino (1/8).

Il Capponi, pronuove la costruzione della cappella sulle antiche ceneri della città di Semifonte distrutta completamente dai fiorentine già dal 1202 dopo un'aspra battaglia che vide soccombere la fiorente cittadina valdelsana. Ricordato anche da Dante nella Divina Commedia.

Questa vittoria però con il tempo diventò, nella memoria collettiva un macchia nella fiorente e progredita civiltà fiorntina, inquanto era stata distrutta una città che stava crescendo nelle dimensioni e nell'importanza e che stava diventando una vera potenza e la Chiesa aveva anche scomunicato la città di Firenze per i beni di proprietà ecclesiastica andati definitivamente distrutti. Sono infatti di quel periodo i versi "Fiorenza fatti in là che Semifonte si fa città"

Vale veramente la pena di raggiungere quest'angolo di storia, respirare le origini di una popolazione che si è poi amalgamata con la città che l'ha conquistata e ne è diventata parte integrante.